Derrotada la rebelión delahuertista, Plutarco Elías Calles gana las elecciones en 1924. Su periodo se ve marcado por dos guerras; el choque con la iglesia católica, que desata la Guerra Cristera y la disputa por el poder, después de las elecciones presidenciales. Calles enfrenta un conflicto armado con la iglesia católica por limitar el culto, que deja un saldo de cerca de 70 mil muertos sobre todo en el occidente y centro del país. Reforma la Constitución para permitir la reelección presidencial de Obregón, quien regresa de su retiro para comenzar su campaña presidencial. Obregón sufre un atentado perpetrado por los Cristeros. Calles endurece su postura contra la Iglesia. Obregón, gana ampliamente las elecciones el 1 de julio de 1928. Dos semanas después, es asesinado por un militante cristero; José León Toral. En su último informe de gobierno, Plutarco Elías Calles declara que con la muerte de Obregón termina la etapa de caudillos comienza la de las instituciones.