Une bataille épique pour la Terre a lieu lorsque la flotte principale Boddole Zer de plus de 4.000.000 de navires de guerre arrivent au-dessus de l'atmosphère terrestre. Grâce à la puissance de la culture du chant de Lynn Minmay, le Macross, avec sa flotte alliée Zentradi, tente une percée audacieuse à travers les forces de Boddole Zer. Les héros vont mourir, un monde peut tomber, mais l'amour l'emportera-t-il ?