Comme une flotte de vaisseaux de guerre Goa'uld se dirige tout droit vers la Terre, menaçant de la détruire, la base du SGC se prépare au pire, en envoyant les meilleurs et les plus brillants de la société américaine à travers la porte des étoiles vers le site Alpha, une planète sûre. Pendant ce temps, O'Neill et son équipe se servent d'une Porte des Etoiles (cf. Saison 1 - Dans le Nid du Serpent) pour arriver dans le vaisseau commandé par Klorel, le fils d'Apophis. L'équipe SG-1 tente une mission suicide, en plaçant des explosifs à bord pour essayer de stopper l'attaque. Ils sont