Tandis que Lysandre poursuit son plan pour prendre le contrôle d’Illumis, nos héros font de leur mieux pour le vaincre. Sacha et ses Pokémon ont été capturés mais, quand Alain réalise que son travail avec Lysandre a mené à ce désastre, il les aide à se libérer. Sacha et Alain unissent leurs forces pour défier Lysandre dans un combat.