L'agente Bishop è alle prese con l'addestramento su una nave della guardia costiera, quando Gibbs intravede un corpo in mare. Si scopre che si tratta di un criminale che due anni prima aveva assalito il comandante della portacontainer "Il San Dominik". Gibbs, assieme ad un sottufficiale della guardia costiera, salgono sulla portacontainer. Ben presto scoprono che sono alle prese con un sequestro, architettato dal comandante della nave, assieme ai banditi, per cercare di mettere le mani su dei soldi, appartenenti ad una compagnia. Gibbs riesce a sventare il tutto, facendo arrestare i criminali e disinnescando una bomba. DiNozzo arresta il comandante in procinto di fuggire con i soldi.