Hai điệp viên có xuất thân hoàn toàn khác nhau hợp sức để giải quyết các vụ án mà FBI gọi là X-Files, liên quan đến các hiện tượng huyền bí hoặc không thể giải thích. Cả hai đều quyết tâm khám phá những sự thật ẩn giấu — một người tìm kiếm câu trả lời khác thường, người kia tìm kiếm những lời giải thích khoa học trần tục hơn. Cùng nhau, họ sẽ khám phá ra những điều mà không ai có thể tưởng tượng ra.