Junko revela que ella había usado a Mukuro, su hermana gemela mayor, para tomar su lugar, antes de mostrar las otras imágenes del mundo exterior, revelando que estaba en un caos total. Esto es confirmado por Genocider, quien conservó sus recuerdos ya que se mantienen separados de los de Toko, con Junko revelando posteriormente que los recuerdos que fueron robados de los estudiantes en realidad fueron de dos años completos pasados juntos en Hope's Peak Academy. Hace un año, cuando "The Tragedy" llegó al mundo, la escuela se convirtió en un refugio para proteger a los estudiantes que llevaban la esperanza sobre sus hombros. Sin embargo, Junko mató al director, borró los recuerdos de los estudiantes y comenzó el juego de matar, traicionando a su propia hermana en el proceso. Junko luego tiene una votación final entre la esperanza y la desesperación; si todos votan por la esperanza, deben abandonar la academia, pero si un estudiante votase a favor de la desesperación, los estudiantes permanecerán en la academia y solo Makoto será ejecutado. Makoto logra usar su propia esperanza para inspirar a los demás a enfrentarse a la desesperación, ganándose el nuevo título de Super High School Level Hope. Con el juicio terminado, Junko se revela a sí misma en la desesperación máxima y se da a sí misma la última ejecución, dejando atrás un interruptor de escape. Con esperanza en sus corazones, Makoto y los demás usan el interruptor para abandonar la academia y aventurarse en el mundo desconocido, sin saber que Monokuma todavía está activo. Junko se deleita en la desesperación máxima y se da a sí misma la última ejecución, dejando atrás un interruptor de escape. Con esperanza en sus corazones, Makoto y los demás usan el interruptor para abandonar la academia y aventurarse en el mundo desconocido, sin saber que Monokuma todavía está activo. Junko se deleita en la desesperación máxima y se da a sí misma la última ejecución, dejando atrás un interruptor de escape. Con esperanza en sus corazones, Makoto y los demás usan el interruptor para abandonar la academia y aventurarse en el mundo desconocido, sin saber que Monokuma todavía está activo.