In un giorno di primavera, Liones Yelistratova, Principessa di un piccolo regno, si iscrive in una scuola dell'Hokkaido. L'istituto è un ente formativo specializzato gestito dall'ALCA per la preparazione dei Logicalist, che preservano la pace nel mondo. Liones è assegnata alla sezione S, dove incontra alcuni compagni di classe dalle personalità veramente peculiari, e tra questi Nina. Ecco che una frizzante e dolce quotidianità ha inizio.